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中国团队Nature重磅论文:新冠病毒或由穿山甲冠状病毒与蝙蝠冠状病毒重组产生

新冠病毒的“罪魁祸首”到底是谁?蝙蝠?穿山甲?从新冠疫情爆发之初,到如今全球累计确诊病例数逾383万,这个问题仍然没有确切的答案。

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本文摘要:新冠病毒的“罪魁祸首”到底是谁?蝙蝠?穿山甲?从新冠疫情爆发之初,到如今全球累计确诊病例数逾383万,这个问题仍然没有确切的答案。

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新冠病毒的“罪魁祸首”到底是谁?蝙蝠?穿山甲?从新冠疫情爆发之初,到如今全球累计确诊病例数逾383万,这个问题仍然没有确切的答案。近日,我国研究人员给出了最新的答案:新冠病毒可能是由穿山甲冠状病毒与蝙蝠冠状病毒重组产生!当地时间2020年5月7日,来自华南农业大学兽医学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室(包括其肇庆分中心)、广州动物园、中国农业大学生物学院农业生物技术国家重点实验室及广东省野生动物救护中心的研究团队于国际著名期刊《自然》在线发表了题为IsolationofSARS-CoV-2-relatedcoronavirusfromMalayanpangolins(马来亚穿山甲中新冠病毒相关冠状病毒的分离)的论文。

到底是谁的锅?新冠病毒的中间宿主可能是蝙蝠疫情期间,我们最不该觉得陌生的一串英文无疑是新冠病毒的国际通用名称SARS-CoV-2。此前报道过,国际范围内病毒的命名均由国际病毒分类委员会负责,此次肆虐全球的新冠病毒之所以被国际病毒分类委员会命名为SARS-CoV-2,原因就在于新冠病毒SARS-CoV-2与多年前的“非典”病毒SARS-CoV之间的关系——二者存在明显区别,SARS-CoV-2有其新颖性,但同时二者属于同一类型,具有亲缘性。早在新冠疫情爆发之前,相关研究人员就发现,当年的“非典”病毒SARS-CoV毒株源自蝙蝠。

那么顺着这条思路,作为“非典”病毒的亲戚,新冠病毒的罪魁祸首会不会也是蝙蝠呢?早在当地时间2020年1月23日,中科院武汉病毒所石正丽团队就在预印本网站bioRxiv上发表论文指出,新冠病毒的中间宿主可能是蝙蝠。具体来讲,该团队从5名患者体内获得了SARS-CoV-2病毒的全基因组,发现这5例基因组基本上一致。SARS-CoV-2在整个基因组中与在云南中华菊头蝠身上检测到的冠状病毒Bat-CoV-RaTG13有96.2%的一致性,与SARS-CoV有79.5%的一致性。

经过同行评议后,该论文随后于当地时间2020年2月3日正式发表于《自然》期刊。新冠病毒的中间宿主可能是穿山甲然而,科学的魅力就在于不断探索、提出新发现,推翻或是印证前人的观点。

2020年2月7日,华南农业大学针对新型冠状病毒肺炎疫情研究攻关情况举行了新闻发布会。会上,华南农业大学、岭南现代农业科学与技术广东省实验室沈永义、肖立华等科研人员表示,穿山甲可能为新冠病毒的潜在中间宿主。据了解,该团队这一结论的得来过程,主要分四步:首先,通过分析1000余份宏基因组样品,确定穿山甲为潜在中间宿主;其次,通过分子生物学检测,揭示穿山甲中β冠状病毒的阳性率为70%;随后,进一步对病毒进行分离鉴定,在电镜下观察到典型的冠状病毒颗粒结构;最终,通过对病毒的基因组分析,发现分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%。

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在这之后,由顶尖病毒学家管轶领衔的研究团队,再次证明穿山甲是新冠病毒的中间宿主——2020年2月18日,香港大学管轶团队与广西医科大学胡艳玲团队在预印本网站bioRxiv上发表了题为Identificationof2019-nCoVrelatedcoronavirusesinMalayanpangolinsinsouthernChina(中国南方马来亚穿山甲中2019-nCov相关冠状病毒的鉴定)的论文。根据当时的报道,研究人员共对三批穿山甲样本进行了分析与研究——2017年8月-2018年1月广西海关在反走私行动中查获的18个冷冻穿山甲的(肺、肠、血液)等43个组织样品;2018年5-7月的12只穿山甲的19个样本(9个肠组织、10个肺组织);广州海关技术中心在2019年3月反走私行动中查获的5个归档穿山甲样品(2个皮肤拭子、1个不明组织、1块鳞片)。

结果表明:在穿山甲样本中发现的冠状病毒Pangolin-CoV基因组与SARS-CoV-2基因组的相似率为85.5%-92.4%;SARS-CoV-2与Pangolin-CoV受体结合域的氨基酸序列相似性高达97.4%,而与Bat-CoV-RaTG13受体结合域的氨基酸相似度仅89.2%;Pangolin-CoV和SARS-CoV-2在病毒受体区域的5个关键残基上共享氨基酸,而Bat-CoV-RaTG13只与SARS-CoV-2共享一个氨基酸。因此,相较于蝙蝠,穿山甲更有可能是新冠病毒的中间宿主。同样在经过同行评议后,这一论文最终于当地时间2020年3月26日正式发表于《自然》期刊。

新冠病毒或由两种冠状病毒重组产生了解到,2003年管轶团队率先分离出SARS病毒,证实了果子狸为其中间宿主,也是人类感染SARS的直接来源,之后与钟南山院士一起上报,对于当时疫情的遏制起到了关键性作用。不过,虽然管轶教授在病毒学领域颇有建树,但寻找新冠病毒源头的过程并未就此画上句号。

近日,由华南农业大学领衔的团队在论文中再次给出了新答案。具体来讲,研究人员从25个马来亚穿山甲样本中的17个里分离得到一种冠状病毒,即前文所述的Pangolin-CoV,发现:Pangolin-CoV的E、M、N和S基因与SARS-CoV-2的同源性分别为100%、98.6%、97.8%和90.7%;Pangolin-CoVS蛋白内的受体结合结构域实际上与SARS-CoV-2的受体结合结构域相同,仅具有一个非关键氨基酸差异。上图为Pangolin-CoV的基因组表征。

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基于上述发现,研究人员表示,SARS-CoV-2可能源自Pangolin-CoV与Bat-CoV-RaTG13的重组。此外,研究人员也展示了经由Pangolin-CoV诱发的穿山甲肺部可能出现的病理变化。如下图所示,a部分为阴性(健康状态),b、c、d均为感染了Pangolin-CoV的状态,展示了肺泡上皮细胞和含铁血黄素色素的增殖和脱屑现象,其中c有严重的毛细血管充血。

另外,e为肺组织双膜囊泡的透射电子显微镜图像,右上角清晰可见冠状病毒。实际上,论文也明确提到:穿山甲是被贩卖次数最多的哺乳动物,如果野生动物贸易得不到有效控制,未来其身上的冠状病毒可能还将会对公众健康构成威胁。

虽然这一结论仍有可能不是最终的答案,但也为找寻新冠病毒的源头提供了新的思路。期待“真理”早日浮出水面,这场疫情也尽快结束。引用来源:[1]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7[2]https://scau.edu.cn/2020/0207/c1300a219015/page.htm[3]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2169-0[4]https://www.nature.com/articles/s41586-020-2313-x原创文章,未经授权禁止转载。

详情见转载须知。


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